Prokaryotická buňka je typ buňky charakteristický pro bakterie a archea (tedy souhrnně Prokaryota). Je o řád menší než buňka eukaryotická, vyznačuje se také jednodušší organizací. Prokaryotické buňky mají značné množství charakteristických vlastností.

Prokaryota jsou vždy jednobuněčné organismy, netvoří tedy tkáně.

Uvádí se tři klíčové charakteristiky prokaryotických buněk:

• organizace nukleoidu (bakteriální obdoby jádra) — nukleoid není oddělen od okolní cytoplazmy membránou, skládá se jen z jedné velké molekuly DNA, na níž nejsou histony ani jiné bazické bílkoviny, je haploidní;
• nepřítomnost organel — v prokaryotické buňce nejsou mitochondrie, plastidy, endoplazmatické retikulum ani jiná organela s membránou;
• vlastnosti ribozomů — ribozomy prokaryot se od eukaryot liší svou hmotností i velikostí

K dalším typickým, nikoliv však nutně všeobecným, vlastnostem patří:

• peptidoglykan, součástí buněčné stěny (výjimkou jsou mykoplazmy a archebakterie)
• jednodušší stavba bičíků než u eukaryot (nemusí však být nutně přítomny)
• anaerobióza, schopnost žít anaerobně, je u prokaryot častější než u eukaryot
• schopnost vázat vzdušný dusík, unikátní pro některé prokaryota
• nepřítomnost pinocytózy, fagocytózy a exocytózy
• asi desetkrát menší velikost než eukaryotická buňka